僕はバイオインフォマティクスの会社に勤めているんですけど、統計関係の仕事をしています*1。 なので、たまにバイオの人から統計関係の相談を持ちかけられることがあります。 今回、ちょっとおもしろいことを相談されて、頭を悩ませたので、ここで紹介しよ…

Paired-End ってよく見かけるけどなんだろう？と思ってググると、そのものずばりの質問がありました。 what is a paired-end read? http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=503 面白かったので一部適当に翻訳してみました。間違いの指摘などは大歓迎…

この業界に入って丸2年が経ちました。早いものです。まったく違う分野からの参入なので、まだまだわからないことだらけです。日々勉強です。 この2年でバイオ系の本を数冊読みましたが、ちょっと疑問に思っていることがありました。それはこれです。 *1 これ…

Velvet や ABySS などの代表的な de novo アセンブリツールでは、アルゴリズムに de Bruijn Graph というのを使っているそうです。どうやってアセンブルしているんだろう？と興味を持っていたので、元ネタの An Eulerian path approach to DNA fragment asse…